CellCelector 소프트웨어
CellCelector는 개별 단일 세포와 콜로니의 자동 분석 및 채취를 위한 매우 다재다능하고 유연한 시스템입니다. 이를 위해서는 CellCelector의 다양한 기능에 액세스할 수 있는 똑같이 유연하고 강력한 소프트웨어가 필요합니다.
직관적이고 사용하기 쉬운 그래픽 사용자 인터페이스는 실험의 모든 단계를 통해 작업자를 안내합니다. 다양한 사용자 액세스 수준을 통해 신규 작업자가 집중적인 교육 없이도 소프트웨어에 쉽게 액세스할 수 있으며 고급 사용자를 위한 고급 기능, 모든 파라미터에 대한 개방형 액세스, 보정 및 사용자 지정 기능을 제공합니다. 따라서 간단한 일상적인 사용은 물론 정교하고 복잡한 실험을 수행할 수 있습니다.
CellCelector 소프트웨어의 사용자 인터페이스는 실험을 5가지 워크플로우 단계로 분리막하여 시스템의 표준 실험 워크플로우에 맞춰져 있습니다:
각 실험 단계는 전용 사용자 인터페이스에 표시되어 해당 단계에 적합한 양의 기능과 데이터에 액세스. 현재 실험 단계와 관련이 없는 모든 옵션과 기능은 작업자에게 숨겨져 있어 복잡성 감소.
샘플이 담긴 플레이트와 접시는 전동 현미경 스테이지를 사용하는 고해상도 카메라로 자동 스캔됩니다. 플레이트는 가장 일반적인 상업용 플레이트 형식이 포함된 플레이트 라이브러리에서 선택되며 맞춤형 형식을 만들 수 있습니다. 필요한 경우 플레이트, 접시 또는 슬라이드를 쉽게 추가할 수 있습니다.
애플리케이션 요구 사항에 따라 밝은 필드, 위상차 또는 최대 6개의 형광 채널에서 스캔을 수행할 수 있습니다. 카메라 설정(예: 노출 시간)부터 하드웨어 설정(예: 필터 설정) 및 조명 매개변수에 이르기까지 모든 이미징 매개변수가 사전 정의된 이미징 구성에 저장됩니다. 따라서 마우스 클릭 한 번으로 다양한 이미징 설정 간에 전환할 수 있습니다. 스캔 시 사전 정의된 이미징 구성의 모든 조합을 선택하여 다양한 채널과 조명 방식에 걸쳐 다중 스펙트럼 이미지를 획득할 수 있습니다.
저장된 모든 스캔 이미지는 소프트웨어에 의해 스캔한 영역의 개요 이미지로 결합됩니다:
이 단계에서 저장된 모든 이미지를 분석하고 작업자가 규명된 매개변수를 기반으로 표적 세포와 콜로니를 자동으로 감지합니다.
각 기록 채널에서 감지된 각 세포 또는 콜로니에 대해 소프트웨어는 면적, 직경, 모양, 구형성(둥근 정도) 등과 같은 형태학적 측정 패널을 계산합니다. 이러한 파라미터에 필터 게이팅을 사용하면 분석 결과를 필터링하여 목표 세포와 콜로니만 구체적으로 검출할 수 있으며, 사용자 친화적인 미리보기 기능을 통해 분석 설정을 실시간으로 확인하고 조정할 수 있습니다.
모든 파라미터를 사전 정의된 분석 설정으로 저장하여 표준 실험을 쉽게 일상적으로 분석할 수 있습니다.
분석하는 동안 소프트웨어는 감지된 각 세포 또는 콜로니에 대해 선택한 모든 측정 데이터를 보여주는 모든 감지된 개체 목록을 생성합니다. 필요한 경우 운영자는 추가 수치 필터를 적용하거나 이미지 갤러리에서 감지된 세포의 이미지를 검토하여 이 목록을 수정할 수 있습니다. 화면에서 직접 흥미로운 개체를 선택하여 채취 목록에 추가 항목을 추가할 수도 있습니다.
CellCelector는 채취된 세포 또는 콜로니의 높은 생존율로 매우 부드러운 채취 프로세스를 용이하게 합니다. 따라서 CellCelector는 추가 세포 배양, 단일 세포 클로닝 또는 다양한 분자 분석 방법에 완벽하게 적합합니다.
CellCelector 소프트웨어는 작업자가 다양한 채취 파라미터(예: 흡인 및 분주기 속도, 부피, 채취 높이 등)에 액세스할 수 있도록 지원함으로써 이를 뒷받침합니다. 이러한 매개변수를 개별적으로 조정하고 최적화하여 개별 단일 세포, 현탁액 또는 반고체 배지의 클론, 부착된 콜로니에서 이상적인 채취 결과를 얻을 수 있습니다.
이러한 매개변수를 최적화하면 표준 세포 배양 접시 또는 웰 플레이트뿐만 아니라 막, 필터 또는 현미경 슬라이드에서도 물체를 채취할 수 있습니다.
채취하는 동안 세포는 소스 위치에서 목적지 플레이트와 웰까지 추적됩니다. 또한 소프트웨어는 채취 중에 라이브 이미지를 표시하여 작업자가 셀 채취 절차를 현미경으로 볼 수 있어 채취 파라미터를 쉽게 최적화할 수 있습니다.
품질 관리를 위해 소프트웨어는 각 채취 직전과 직후에 이미지를 자동으로 저장하여 나중에 채취 결과를 검토할 수 있습니다(BF 또는 형광 채널에서). 선택적으로 소프트웨어는 채취 목록에 각 채취의 상태를 자동으로 기록하여 성공적인 채취를 확인할 수 있습니다.
전체 실험 데이터는 소프트웨어의 문서화 페이지에 GLP를 준수하는 목록과 문서화되어 있습니다. 모든 데이터는 문서화 및 보관을 위해 빠르고 쉽게 내보낼 수 있습니다.
각 검출/채취된 개체는 고유 ID로 식별할 수 있으며 소스에서 대상까지 전체 과정을 잘 추적할 수 있습니다.
모든 이미징 및 수치 데이터는 물론 모든 세포 및 클론의 현미경 품질 전후 이미지가 CellCelector 소프트웨어 데이터베이스에 저장됩니다. 각 셀의 소스 및 대상 위치는 동일한 목록에 기록됩니다. 이렇게 하면 나중에 다운스트림 데이터(예: PCR 또는 배양 데이터)를 사용할 수 있게 되면 이미징 및 채취 데이터를 쉽게 다시 살펴볼 수 있습니다.
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